Recientemente tuve el mismo problema, hice lo siguiente:
Digamos que descargó el archivo SQLServer2008R2SP1-KB2528583-x86-ENU file
para obtener SQL 2008 R2 y no aceptará la carpeta que elija. Está buscando sus archivos AKA de medios de instalación para instalar la opción elegida, p. Actualizar o instalar.
Haga clic derecho en el archivo SQLServer2008R2SP1-KB2528583-x86-ENU, haga clic en extraer archivos (opciones winrar). Esto extraerá el archivo de instalación y le dará todos los archivos comprimidos.
Cuando el Centro de instalación de SQL 2008 R2 le pida que elija la carpeta, seleccione la carpeta extraída con todos los archivos... ¡problema resuelto!