Hay una buena publicación aquí que detalla una forma de hacer esto.
Necesitará usar un ConnectionManager y configurar la propiedad ConnectionString de eso desde un Paquete de configuración.
La propiedad ConnectionString es una cadena de conexión de base de datos completamente calificada, como
Data Source=localhost;Initial Catalog=SSISConfig;Provider=SQLNCLI.1;Integrated Security=SSPI;Auto Translate=False;
Hay algunos problemas y molestias con el uso de paquetes de configuración, por lo que es posible que tenga que jugar un poco. Sería más detallado, pero ha pasado aproximadamente un año desde la última vez que trabajé en un proyecto de SSIS.
Si tiene algún problema específico, vuelva y comente sobre lo que ha encontrado. Trataré de reavivar los viejos recuerdos.