Error al modificar DAL, System.ArgumentException, ya existe una entrada con la misma clave

Tuve exactamente el mismo problema. Como noté, el problema apareció después de fusionar archivos .edmx con Subversion. Mirando el archivo .edmx en el editor de texto, encontré una entrada EntitySetMapping duplicada. Después de eliminar manualmente el duplicado, ¡el problema se resolvió! Espero que esto ayude