Clase compleja de cadena de campo - número - cadena

Esta solución es más confiable que la respuesta elegida. Es posible que esta respuesta no dé la respuesta esperada si hay más de 1 número como 'EPA WELL 5 7' en la estación. Esta solución es rellenar el número con '0' para que la comparación considere todos los números de 8 dígitos.

DECLARE  @Table1 table([station] varchar(26))

INSERT INTO @Table1
    ([station])
VALUES
    ('ANTIL WELL 2'),
    ('ANTIL WELL 1'),
    ('BASELINE & CALIFORNIA WELL'),
    ('EPA WELL 7'),
    ('EPA WELL 6'),
    ('EPA WELL 108'),
    ('EPA WELL 109'),
    ('EPA WELL 110'),
    ('EPA WELL 111'),
    ('EPA WELL 112'),
    ('EPA WELL 108S'),
    ('EPA WELL 111108')
;

SELECT station
FROM @table1
ORDER BY 
CASE WHEN station not like '%[0-9]%' THEN station ELSE
   STUFF(station, PATINDEX('%[0-9]%',station), 0, replicate('0', 
   PATINDEX('%[0-9]%',station) - len(station) + PATINDEX('%[0-9]%',reverse(station)) + 6))
END

*La respuesta de GoatCD no dará el orden correcto en mis datos de prueba.