¿La mejor manera de obtener la identidad de la fila insertada en el servidor vinculado?

Podría usar el sp_executesql del lado remoto :

DECLARE @ScopeIdentity TABLE (ID int);
INSERT INTO @ScopeIdentity
EXEC server.master..sp_executesql N'
  INSERT INTO database.schema.table (columns) VALUES (values);
  SELECT SCOPE_IDENTITY()';
SELECT * FROM @ScopeIdentity;

Alternativamente, podría usar OPENQUERY :

SELECT *
FROM OPENQUERY(server, '
  INSERT INTO database.schema.table (columns) VALUES (values);
  SELECT SCOPE_IDENTITY() AS ID');