Este problema existe desde hace años en SQL Server. Por lo general, lleva un tiempo iniciar y detener el depurador antes de que se sincronice con la versión correcta de la fuente.
También notará que se abren algunas ventanas que muestran la última fuente que el depurador conoce. Necesitan estar cerrados. Aunque es un pita, la forma más rápida de solucionar el problema es detener Management Studio y reiniciarlo.
