Su problema no es con el volumen de datos per se , es que algunas de tus tuplas contienen numpy.int64 valores que no se pueden usar directamente como valores de parámetro para su instrucción SQL. Por ejemplo,
a = numpy.array([10, 11, 12], dtype=numpy.int64)
params = (1, 1, a[1], 1, 1, 1)
crsr.execute(sql, params)
lanzará
porque el valor del tercer parámetro es un numpy.int64 elemento de su matriz numpy a . Convirtiendo ese valor con int() evitará el problema:
a = numpy.array([10, 11, 12], dtype=numpy.int64)
params = (1, 1, int(a[1]), 1, 1, 1)
crsr.execute(sql, params)
Por cierto, la razón por la que
sql = 'SET GLOBAL max_allowed_packet=50*1024*1024'
cursor.execute(sql)
no funcionó es que max_allowed_packet es una configuración de MySQL que no tiene ningún significado para Microsoft SQL Server.
