Para hacer una copia de seguridad de una sola base de datos desde la línea de comandos, use osql o sqlcmd.
"C:\Program Files\Microsoft SQL Server\90\Tools\Binn\osql.exe"
-E -Q "BACKUP DATABASE mydatabase TO DISK='C:\tmp\db.bak' WITH FORMAT"
También querrá leer la documentación sobre RESPALDO y RESTAURACIÓN y los procedimientos generales.