Una conexión confiable es lo mismo que usar la autenticación de Windows en SQL Server 2005. La autenticación la realiza el dominio y la autorización la maneja SQL Server.
SQL Server también puede usar sus propios inicios de sesión, como sa usuario. Ambos están autenticados y autorizados por SQL Server. Solo son viables si SQL Server se ejecuta en modo de autenticación mixta.
MSDN tiene un buen artículo sobre cómo elegir el modo de autenticación correcto. Es una buena base.
