Actualizar registros en tabla desde CTE

Las actualizaciones que realice en el CTE se conectarán en cascada a la tabla de origen.

Tuve que adivinar un poco tu esquema, pero algo como esto debería funcionar.

;WITH T AS
(   SELECT  InvoiceNumber, 
            DocTotal, 
            SUM(Sale + VAT) OVER(PARTITION BY InvoiceNumber) AS NewDocTotal
    FROM    PEDI_InvoiceDetail
)
UPDATE  T
SET     DocTotal = NewDocTotal