Las bases de datos de SQL Server utilizan dos archivos:un archivo MDF, conocido como archivo de base de datos principal, que contiene el esquema y los datos, y un archivo LDF, que contiene los registros. Ver wikipedia. Una base de datos también puede usar un archivo de base de datos secundario, que normalmente usa una extensión .ndf.
Como indica John S., estas extensiones de archivo son puramente convencionales:puede usar lo que quiera, aunque no puedo pensar en una buena razón para hacerlo.
Más información sobre MSDN aquí y en Introducción a la administración de SQL Server 2005 (Google Books) aquí.
